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刘俊杰

刘俊杰

 

2007-2011,四川大学--生命科学与技术基地班,学士

2011-2016,北大-清华-NIBS联合培养(PTN)项目,博士

2016-2018,劳伦斯-伯克利国家实验室--生物物理和生物成像中心,博士后

2018-2020,加州大学伯克利分校--细胞分子生物学系,博士后

2018-2020,美国生命科学研究基金(LSRF)研究员

2020,10月起,清华大学--生命科学学院、999.8vnsr威尼斯人、高精尖结构生物学中心,助理教授、研究员、博士生导师

 

研究领域

本实验室主要利用生物信息学,生物化学,生物物理学以及细胞生物学手段从事以下研究

(1)    RNA及蛋白质互作体系的分子共进化研究

(2)    新型CRISPR系统鉴定,分子进化及应用研究

(3)    重大疾病相关的lncRNA结构功能研究及潜在治疗手段开发


 

代表性论文

1. Deng P#, Tan SQ#, Yang QY, Fu L, Wu Y, Zhu HZ, Sun L, Bao Z, Lin Y, Zhang QC, Wang H, Wang J*, Liu JJ*. Structural RNA components supervise the sequential DNA cleavage in R2 retrotransposon. Cell. 2023 Jun 22;186(13):2865-2879.

2. Sun A#, Li CP#, Chen Z#, Zhang S#, Li DY, Yang Y, Li LQ, Zhao Y, Wang K, Li Z, Liu J, Liu S, Wang J*, Liu JJ*. The compact Casπ (Cas12l) 'bracelet' provides a unique structural platform for DNA manipulation. Cell Res. 2023 Mar;33(3):229-244.

3. Hu Z#, Sun A#, Yang J, Naz G, Sun G, Li Z, Liu JJ*, Zhang S*, Zhang X*. Regulation of the CRISPR-Cas12a system by methylation and demethylation of guide RNA. Chem Sci. 2023 May 9;14(22):5945-5955.

4. Li DY#, Li LQ#, Liu JJ*. Nucleases in gene-editing technologies: past and prologue. National Science Open. 2023 (in press)

5. Tsuchida CA#, Zhang S#, Doost MS#, Zhao Y#, Wang J, O'Brien E, Fang H, Li CP, Li D, Hai ZY, Chuck J, Brötzmann J, Vartoumian A, Burstein D, Chen XW, Nogales E, Doudna JA*, Liu JJ*. Chimeric CRISPR-CasX enzymes and guide RNAs for improved genome editing activity. Mol Cell. 2022 Mar 17;82(6):1199-1209.

6. Yang M, Sun R, Deng P, Yang Y, Wang W, Liu JJ*, Chen C*. Nonspecific interactions between SpCas9 and dsDNA sites located downstream of the PAM mediate facilitated diffusion to accelerate target search. Chem Sci. 2021 Aug 20;12(38):12776-12784.

7. Liu TY#, Liu JJ#, Aditham AJ, Nogales E, Doudna JA*. Target preference of Type III-A CRISPR-Cas complexes at the transcription bubble. Nat Commun. 2019 Jul 5;10(1):3001.

8. Liu JJ#, Orlova N#, Oakes BL#, Ma E, Spinner HB, Baney KLM, Chuck J, Tan D, Knott GJ, Harrington LB, Al-Shayeb B, Wagner A, Brötzmann J, Staahl BT, Taylor KL, Desmarais J, Nogales E*, Doudna JA*. Author Correction: CasX enzymes comprise a distinct family of RNA-guided genome editors. Nature. 2019 Apr;568(7752):E8-E10.

9. Jiang F#, Liu JJ#, Osuna BA#, Xu M, Berry JD, Rauch BJ, Nogales E, Bondy-Denomy J*, Doudna JA*. Temperature-Responsive Competitive Inhibition of CRISPR-Cas9. Mol Cell. 2019 Feb 7;73(3):601-610.

10. Wright AV#, Liu JJ#, Knott GJ, Doxzen KW, Nogales E, Doudna JA*. Structures of the CRISPR genome integration complex. Science. 2017 Sep 15;357(6356):1113-1118.

 

#: Co-first author;    *: Corresponding author

 

联系方式

 

电子邮件:junjiegogoliu(at)tsinghua.edu.cn (联系时请把(at)改成@)

实验室电话:010-62770270

实验室通讯地址:北京市海淀区清华大学生物医学馆A401

实验室主页:http://gogolab.life.tsinghua.edu.cn/ 

 

 

 

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